水液相下羟基负离子(水分子簇)催化脯氨酸旋光异构的理论研究

作者:刘军; 唐晓文; 潘宇; 刘芳; 张雪娇; 马宏源; 王佐成*
来源:中山大学学报:自然科学版(中英文), 2022, 61(04): 85-94.
DOI:10.13471/j.cnki.acta.snus.2020c023

摘要

采用密度泛函理论的M06-2X和MN15方法与自洽反应场理论的SMD模型方法,研究水液相下羟基负离子水分子簇催化S-型两性脯氨酸分子(S-Pro)的旋光异构。首先考察了S-Pro异构成中性亚氨基酸后,羟基负离子(水分子簇)抽取α-H,脯氨酸-碳负离子抽取水分子(簇)的质子,S-Pro旋光异构的反应通道;然后考察了羟基负离子(水分子簇)直接抽取S-Pro的α-H,脯氨酸-碳负离子抽取水分子(簇)的质子,以及S-Pro旋光异构的反应通道。势能面计算表明:S-Pro异构成中性亚氨基酸后,羟基负离子(水分子簇)抽α-H的通道最具优势,决速步的自由能垒为46.9~59.1 kJ·mol-1。羟基负离子(水分子簇)直接抽两性S-Pro的α-H的反应通道是劣势通道,决速步的自由能垒为70.8 kJ·mol-1。结果表明,碱性环境下脯氨酸的消旋反应会温和地进行。

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