基于生物信息学研究IGFBP在肝癌中表达及其预后价值

作者：戴斌; 王再兴^*; 马丹丹; 金炜东; 张智勇; 王德盛

来源：中华肝脏外科手术学电子杂志, 2020, 9(06): 602-608.

• 癌,肝细胞
• 胰岛素样生长因子结合蛋白质类
• 预后
• 计算生物学

目的通过生物信息学分析探讨胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBP)家族成员在肝细胞癌(肝癌)中表达情况和预后价值。方法利用GEPIA在线分析IGFBP家族在肝癌中的基因表达,Kaplan-Meier生存曲线分析IGFBP与预后关系,采用cBioPortal for Cancer Genomics分析肝癌患者中IGFBP基因改变情况。采用GeneMANIA构建IGFBP相关基因作用网络,Metascape数据库基因网络进行基因本体(GO)富集分析。结果 GEPIA在线分析显示肝癌IGFBP3 mRNA相对表达量明显低于正常肝组织(P<0.05)。IGFBP3表达与肿瘤病理分期有关(F=5.52,P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析显示,IGFBP3和IGFBP4 mRNA表达水平与不良预后密切相关(HR=1.50,0.43;P<0.05)。cBioPortal分析显示肝癌中IGFBP发生基因改变,包括突变、融合、扩增、深缺失和多重改变,其中突变、扩增和深缺失是最常见改变。IGFBPs遗传改变0～1%。GeneMANIA分析确定了20个与IGFBPs密切相关的基因,GO富集分析发现IGFBP主要富集在与生长及细胞运动相关的信号通路中。结论基于生物信息学研究发现IGFBP3在肝癌患者组织中表达异常,且与患者预后相关,IGFBP3可能作为肝癌预后生物标志物和治疗潜在靶点。

• 单位
  西京医院; 武汉市第一医院; 中国人民解放军空军军医大学