一株同时产KPC-2和NDM-5碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌耐药基因特征分析

作者：肖伟强; 屈元晔; 王小昆; 孙明月; 常彦敏; 许青霞^*; 毕利军

来源：中华微生物学和免疫学杂志, 2022, 42(09): 669-675.

• 肺炎克雷伯菌
• KPC-2
• NDM-5
• β-内酰胺酶

目的分析一株同时产KPC-2和NDM-5碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌耐药基因特征。方法肺炎克雷伯菌KPN-hnqyy分离自我院血液科一位患者的粪便标本, 使用仪器BD Phenix-M50鉴定菌株并测定最小抑菌浓度;酶联免疫层析试验和PCR方法检测碳青霉烯酶基因型;接合试验检测相关质粒的转移性;PacBio和Illumina平台对菌株全基因组测序, 并在BacWGSTdb数据库中检索菌株MLST分型、耐药基因和质粒类型, 使用软件Easyfig2.2.3比对基因组和开放读码框序列, BRIG v0.95生成可视化质粒圈图。结果肺炎克雷伯菌KPN-hnqyy对碳青霉烯类抗生素耐药, MLST分型为ST11型, blaKPC-2和blaNDM-5碳青霉烯酶基因阳性;接合子blaKPC-2基因阳性, blaNDM-5阴性;全基因组测序显示菌株含有1个染色体和3个质粒;肺炎克雷伯菌KP69和KP19-2029等与本研究菌株染色体基因组相似性大于99.9%, 且其各自携带的不同种类的质粒上含有相似的IncR和IncFⅠ耐药基因融合区, blaKPC-2基因位于此融合区中一个由Tn3-△Tn4401-Tn1721/Tn1722序列演化而来的两端插入IS26转座酶基因的结构中;blaNDM-5基因位于一种含有噬菌体插入片段特殊质粒的Ⅰ型转座子上, 两端也插入了IS26转座酶基因。结论 ST11型肺炎克雷伯菌携带blaKPC-2的IncR和IncFⅡ耐药基因融合区与染色体基因组可能一起广泛存在, 特殊质粒携带的blaNDM-5基因可能是通过IS26转座元件介导的基因重组方式偶然获得;携带blaKPC-2基因的ST11型肺炎克雷伯菌在中国广泛传播并能通过IS26转座元件获得其他碳青霉烯酶基因的能力应引起重视。

• 单位
  郑州大学; 中国科学院生物物理所