基于生物信息学筛选研究衰老小鼠免疫B细胞的基因差异

作者：刘逸南; 刘奕清; 杨静; 修成奎; 王雪; 胡艳红; 吴丹; 吴烨; 雷燕^*

来源：中国老年学杂志, 2023, 43(20): 5033-5038.

• 衰老
• B细胞
• 生物信息学
• 差异表达基因

目的 通过生物信息技术分析GSE72224基因芯片数据，比较衰老小鼠与青年小鼠B细胞基因差异，探索关键基因，为衰老机制研究及药物研发提供思路。方法 通过NCBI提供的GEO数据库下载GSE72224,利用生物信息方法筛选衰老与青年小鼠B细胞差异表达基因，然后对差异表达基因进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因组百科全书(KEGG)信号通路分析，并且构建蛋白质相互作用网络获得关键基因和关键模块。结果 共筛选出87个表达基因，包括其中66个下调基因及21个上调基因。差异表达基因主要参与B细胞活化、内质网及内质网蛋白加工通路等。通过构建蛋白质相互作用网络从而筛选出H2A组蛋白家族成员(H2af)x、Zeste基因增强子人类同源物(Ezh)2、蛋白二硫化物异构酶(Pdi)A4、H2B组家族成员b(Hist2h2bb)、白细胞介素(IL)-10、Sel1l、Dnajb9、泛素样含PHD和环指域(Uhrf)1这8个关键基因。并且筛选出两个重要模块，模块中的基因主要也与内质网蛋白加工通路等有关。结论 H2afx、Ezh2、Pdia4、Hist2h2bb、IL-10、Sel1l、Dnajb9、Uhrf1此8个关键基因，主要参与B细胞发育、DNA甲基化和内质网的蛋白质调控等过程。但是有关基因的上下游作用点还需深入研究。

• 单位
  中国中医科学院医学实验中心