基于网络药理学和分子对接技术探讨自拟“清瘟汤”治疗新型冠状病毒肺炎的机制

作者：马诗瑜; 方洁; 卞晓岚^*; 杨铭^*; 郑岚; 郑林

来源：中国药业, 2020, 29(07): 1-9.

• 新型冠状病毒
• 分子对接技术
• 清瘟汤
• 网络药理学
• 抗病毒
• 作用机制

目的利用中药网络药理学和分子对接技术,探讨清瘟汤作用靶标与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)之间的关联以及多成分、多靶标的治疗机制。方法通过建立化学成分、靶点,筛选主要活性成分和靶标,用Cytoscape软件构建和分析网络,使用String对靶标进行GO及KEGG功能富集分析,采用Autodock软件对"清瘟汤(" QWT)主要活性成分与SARS-CoV-2的3C类似蛋白酶(3CLpro)和血管紧张素转换酶2 (ACE2)蛋白进行分子对接。结果 QWT中共有172个活性成分涉及480个靶标,其中大多数中药归胃经、肺经和脾经,27个活性成分(琥珀酸、香豆素、γ-氨基丁酸、谷氨酰胺、槲皮素、山柰酚、脯氨酸、赖氨酸、木犀草素、色氨酸、L-缬氨酸、胆碱、芹菜素、β-谷固醇、苯丙氨酸、丙氨酸、水杨酸、DL-缬氨酸、羽扇豆酚、腺苷、谷氨酸、熊果酸、大黄素、异鼠李素、黄豆苷元、柠檬酸、阿魏酸)与靶标关系最密切; QWT关键靶点涉及CASP3,CYP1A1,JUN,TP53,HMOX1,ICAM1,FOS,PPARG,CXCR4,SRC,TYR,B2M,MMP9,RPS27A,PSMD3,NPEPPS,CNDP2,TNF,AKT1,APP,NPY1R,CTSS,PTGER3,GGCT,UBB,HLA-A,PTGS2,CXCL8,FUM,PSMC4等,重要靶标富集在感染性疾病、肺部疾病和免疫性疾病三大类疾病通路上,GO分类和KEGG通路富集主要调控抗炎、免疫、血管生成、钙通道等相关。分子对接结果显示,槲皮素、芹菜素、熊果酸、异鼠李素、羽扇豆酚与3CLpro和ACE2蛋白具有一定的亲和力。结论QWT中的活性化合物主要作用于CASP3,CYP1A1,JUN,TP53,HMOX1等靶点,其中有5种化合物可与SARS-CoV-2的2种主要蛋白进行分子对接,QWT总体通过调节多条信号通路,从而可能产生抗SARS-CoV-2作用。

• 单位
  上海中医药大学; 上海交通大学医学院附属瑞金医院; 上海市长宁区光华中西医结合医院; 上海中医药大学附属龙华医院