用微卫星标记分析北方春糜子区黍稷的遗传差异

作者：段政勇; 邢志; 王海岗; 陈凌; Dipak KSantra; 王瑞云^*; 乔治军^*

来源：山西农业科学, 2022, 50(04): 494-503.

• 黍稷
• 高基元SSR
• 遗传多样性
• 遗传结构
• 聚类分析

利用80对高基元SSR引物检测北方春糜子区48份黍稷材料的多态性，用PowerMarker 3.25对多态性进行分析，用Structure 2.2对群体遗传结构进行分析，使用MEGA 5.0构建聚类图，通过PopGen 1.32进行等位基因、有效等位基因数和多样性指数的计算，用NTSYSpc 2.11软件进行主成分分析。结果表明，80个标记在48份材料中检测到206个等位变异，每个位点检测到2～3个，平均2.575个；其中，产生2个变异的位点有34个，产生3个变异的位点有46个。80个位点多样性指数介于0.665 5(RYW95)～1.078 6(RYW166)，平均为0.860 8;80个位点PIC值介于0.185 0(RYW151)～0.706 2(RYW111)，平均为0.453 6。不同地区的黍稷种质间的遗传距离为0.028 6～0.045 6，遗传一致度为0.955 5～0.973 6。基于UPGMA聚类分析，48份黍稷分为3个类群，类群Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ分别以青海、山西和内蒙古材料为主。Structure分析结果将参试材料分为4个群组，分别以青海、内蒙古、甘肃和山西材料为主。PCA主成分分析发现，第1类群试验材料均来自青海，第2类群试验材料均来自甘肃，第3类群试验材料均来自内蒙古，第4类群试验材料均来自山西。通过对北方春糜子区48份样本黍稷的遗传多样性、遗传距离和遗传一致性分析，发现青海省材料具有最丰富的遗传多样性和复杂的遗传背景。

• 单位
  山西农业大学