基于转录组的芥蓝NAC家族成员鉴定与分析

作者：刘涛; 陈家璇; Gefu Wang-Pruski; 郭容芳^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(22): 7332-7341.

DOI：10.13271/j.mpb.020.007332

• 芥蓝
• NAC
• 生物信息学
• 表达分析

本研究运用生物信息学方法，基于转录组数据在甘蓝(Brassica oleracea)基因组中鉴定了28个芥蓝(Brassica alboglabra) NAC家族基因，对该家族成员蛋白基本理化信息、内含子、蛋白保守结构域、MOTIF基序、系统进化树、启动子顺式作用元件和转录组表达量等进行分析。理化性质分析表明，28个BoNAC蛋白序列长度为139～556 aa,16.64～62.27 kD，等电点(pI)在4.5～10.06；拟南芥(Arabidopsis thaliana)和芥蓝的NAC转录因子家族系统发育树分析显示芥蓝和拟南芥NAC基因可分为17个亚族；MEME和保守结构域分析表明28个BoNAC基因都具有NAM结构域的保守基序结构；启动子分析表明BoNAC家族成员受到多种植物激素、胁迫和光的调控；BoNAC家族28个基因在高温处理下转录组中的表达量表明高温上调了大部分BoNAC家族基因的表达量。研究结果对BoNAC家族的后续研究具有一定的意义。

• 单位
  福建农林大学