2021年宁夏回族自治区聚集性新型冠状病毒肺炎疫情分子流行病学分析

作者：裴建新; 刘翔; 龚瑞; 马学平; 李涛; 张银豪; 蒯文和; 赵建华; 司冰倩; 吴忠兰^*

来源：疾病监测, 2022, 37(09): 1192-1197.

• 新型冠状病毒
• 新型冠状病毒肺炎
• 流行病学
• 高通量测序

目的 分析2021年10月宁夏回族自治区（宁夏）新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情的分子流行病学特征，为完善防控措施提供科学依据。方法 收集2021年10月17日至11月6日宁夏COVID-19确诊病例的发病时间、病例分布、人群特征、基因测序结果等信息，进行描述性分析。结果 宁夏2021年10月聚集性疫情共确诊COVID-19病例44例，本轮疫情有2个独立的传播链，平均代间距约4 d，潜伏期中位数为5.3 d(1.1～8.0 d)，最多已传代至3代；获得43例COVID-19病例的全基因组序列，结果表明本起疫情是由VOC/Delta变异株（B.1.617.2进化分支）感染，同武汉参考株（NC＿045512）序列相比，43例病例新型冠状病毒（SARS-CoV-2）基因组序列存在45～50个核苷酸突变位点；SARS-CoV-2刺突（S）蛋白存在12个氨基酸突变位点。结论 Delta毒株导致的疫情呈现出病毒载量高，潜伏期短，传播能力强的特点，境外输入的SARS-CoV-2变异株存在引起本地暴发与流行的风险，需持续对境外输入的SARS-CoV-2毒株进行分子监测。

• 单位
  宁夏回族自治区疾病预防控制中心; 公共卫生学院; 宁夏医科大学