亚急性皮肤型红斑狼疮转录组及免疫细胞浸润分析

作者：付荣; 林泽英^*

来源：重庆医学, 2022, 51(12): 2097-2103.

• 亚急性皮肤型红斑狼疮
• 活体组织检查
• 免疫细胞浸润
• 生物信息学

目的 利用生物信息学分析亚急性皮肤型狼疮(SCLE)的差异表达基因(DEGs)、关键信号通路及免疫细胞浸润情况，为SCLE的认识、药物开发等提供新思路。方法 筛选GSE81071和GSE109248中SCLE和正常对照(NC)皮肤活检组织DEGs,对其进行基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，采用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络及关键分子筛选识别核心基因，利用CIBERSORT分析22种免疫细胞浸润。结果 筛选出34个DEGs,生物学过程主要集中在对病毒的防御反应、Ⅰ型干扰素信号通路等。分子功能主要包括双链RNA结合、腺苷酸转移酶活性、CXCR趋化因子受体结合等。PPI网络分析筛选出前3个核心基因：CXCL10、DDX58和RSAD2。与NC组相比，SCLE组CD4~+活化记忆T淋巴细胞比例明显升高(P=0.007),而Tregs比例明显降低(P=0.001)。结论 CXCL10、DDX58和RSAD2可能是预测SCLE的生物学标志物及潜在的治疗靶点。

• 单位
  广州医科大学附属第二医院