NOX4在胃癌的高表达与M2样巨噬细胞浸润及不良预后相关

作者：周星宇; 叶锦宁; 房得梁; 赵绍基; 孙开宇; 徐建波^*

来源：消化肿瘤杂志(电子版), 2021, 13(03): 169-208.

• 胃癌
• 免疫浸润
• 巨噬细胞
• NADPH氧化酶4

目的筛选与胃癌免疫相关基因(immune-related genes, IRGs)及其预后分析。方法首先通过R软件,分析TCGA数据库胃癌基因表达数据集获得差异表达IRGs,并进一步筛选出与预后相关的IRGs。分析胃癌组织转录组测序数据获得差异表达IRGs,与前者取交集获得关键IRGs。接着,对关键IRGs进行差异分析、生存分析及临床病理特征相关性分析。然后,使用CIBERSORT方法计算胃癌免疫浸润情况,分析关键IRGs与免疫浸润的相关性,使用TIMER数据库分析免疫浸润与患者生存的关系。最后,使用GEPIA工具分析关键IRGs与巨噬细胞相关趋化因子表达的相关性。结果通过分析TCGA来源的数据集获得32个预后相关IRGs,分析转录组测序数据获得46个IRGs,二者取交集得到基因:巨噬细胞清道夫受体1 (macrophage scavenger receptor 1,MSR1)和NADPH氧化酶4(NADPH oxidase 4,NOX4)。与正常组织相比,MSR1和NOX4在胃癌组织均为高表达。NOX4高表达与胃癌患者低生存相关,而MSR1表达与患者生存无显著相关性。NOX4表达与患者临床分期及T分期呈显著正相关,未发现与N和M分期的显著相关性。通过免疫浸润分析发现,NOX4表达与M2样巨噬细胞浸润呈正相关,与浆细胞、记忆B细胞浸润呈负相关。而生存分析发现巨噬细胞高浸润与胃癌患者低生存有关。通过相关性分析发现NOX4与M2样巨噬细胞相关趋化因子呈正相关。结论基于生物信息学筛选出了胃癌免疫浸润的关键基因NOX4,NOX4的高表达与胃癌组织M2样巨噬细胞浸润及不良预后相关。

• 单位
  中山大学附属第一医院