甘蓝型油菜恢复系的群体结构解析及核心种质构建

作者：张格格; 柳海东; 杜德志^*

来源：中国油料作物学报, 2023, 45(02): 231-239.

DOI：10.19802/j.issn.1007-9084.2022175

• 甘蓝型油菜
• 春油菜
• 全基因组重测序
• 群体结构
• 核心种质

为加快选育适应春油菜区的强优势杂交种，解析甘蓝型油菜恢复系的群体结构及构建核心种质，利用全基因组重测序技术对144份恢复系组成的群体进行全基因组扫描，利用3 881 462个SNP标记，计算材料间的遗传距离，确定最优分群数，评估连锁不平衡程度，采用分层取样的方法，结合等位基因数目最大化策略，构建核心种质。结果表明，基于遗传距离和群体结构两种方法，可将群体划分为7类。整个群体中连锁不平衡程度较低。利用CoreHunter软件构建了C30和C40两个较优核心子集，C30包括44份种质资源，C40包括59份。通过评价，核心种质等位基因覆盖度均达到99%，多态信息含量达到0.24,C30和C40这两个核心子集均能代表144份甘蓝型油菜原始种质，其中C30可确定为最终的核心子集，用于亲本杂优分析。

• 单位
  青海大学