宏基因组下一代测序技术对粪类圆线虫病合并其他病原体感染的诊断价值

作者：谭妮; 廖荣煌; 汪单兰; 苏梦婷; 欧阳能太^*

来源：中国热带医学, 2023, 23(12): 1346-1352.

DOI：10.13604/j.cnki.46-1064/r.2023.12.19

• 基因组下一代测序技术
• 粪类圆线虫
• 混合感染

目的 探讨宏基因组下一代测序技术（metagenomic next-generation sequencing, mNGS）对于粪类圆线虫病（strongyloidiasis）合并其他病原体感染的诊断价值和优势。方法 根据纳入和排除标准，回顾性收集2020年11月至2022年10月就诊于中山大学孙逸仙纪念医院并诊断为粪类圆线虫病的5例患者临床资料。分析患者临床特征，比较5例患者共6份样本通过使用mNGS、液基细胞学镜检方法对粪类圆线虫（Strongyloides stercoralis）的检出率，并与采用粪便直接涂片法对5例患者的粪便查找粪类圆线虫虫卵的检出率进行比较。分析比较6份样本的mNGS与细菌和真菌培养结果的一致性。结果 5例患者中有3例为农民。5例患者均存在基础疾病，主要临床表现为发热、咳嗽，影像特征多为玻璃影、密度影。5例患者血常规检查结果中有4例提示中性粒细胞百分比升高，5例患者嗜酸性粒细胞均未见升高。5例患者的降钙素原均升高。5例患者6份样本中，mNGS对粪类圆线虫的检出率为100%，液基细胞学镜检的检出率为50%。5例患者采用粪便直接涂片法查找粪类圆线虫虫卵的检出率为20%。6份样本中，mNGS均检测到人类疱疹病毒5型，有3份样本检测到耶氏肺孢子菌，3份样本检测到烟曲霉菌，2份样本检测到铜绿假单胞菌。除去mNGS检测到的粪类圆线虫和病毒，将培养结果与mNGS检出的细菌和真菌结果进行比较，有1例样本完全一致，2例样本不一致，3例样本部分一致。结论 mNGS对于粪类圆线虫的检出率可能高于粪便直接涂片法和液基细胞学镜检法。相对于常规细菌和真菌培养，mNGS检测范围广，可能更适合用于粪类圆线虫病合并其他病原体感染的检测，对于混合感染具有明显的诊断优势，可能可以作为粪类圆线虫病的早期诊断方法。

• 单位
  中山大学孙逸仙纪念医院