基于生物信息学分析GLIS3在胃癌中表达与免疫浸润的临床意义

作者：王瑞; 马腾达; 屈才浩; 李玉民^*

来源：重庆医学, 2022, 51(17): 3003-3015.

• 胃癌
• GLIS3
• 表达预后
• 基因集富集分析
• 免疫浸润
• 生物信息学

目的 研究GLIS3在胃癌中的表达与预后价值，探索GLIS3在胃癌中免疫细胞浸润情况及其参与的生物学功能。方法 从TCGA数据库中下载胃癌患者GLIS3基因表达谱数据及临床病理信息，比较胃癌组织和癌旁组织中GLIS3的表达差异，分析GLIS3表达与胃癌患者临床病理特征的关系。利用Kaplan-Meier法和Cox回归分析GLIS3表达与胃癌患者临床预后相关性。运用miRWALK、TargetScan及TCGA数据库，预测调控GLIS3异常表达的miRNA。利用GSEA富集分析预测GLIS3在胃癌中可能参与的信号通路。使用TIMER2.0分析GLIS3表达与免疫细胞浸润之间的关系。结果 GLIS3在胃癌组织中表达明显上调，且GLIS3的表达与肿瘤组织学分级相关(P<0.05)。生存分析显示GLIS3高表达患者比低表达患者预后更差，差异有统计学意义(P<0.05),是胃癌的独立预后因素(HR=1.288,95%CI:1.004～1.653,P<0.05)。miR-204-5p在胃癌中表达明显下调，且与GLIS3表达负相关(P<0.05)。富集分析结果显示：GLIS3基因主要富集在细胞外基质(ECM)受体相互作用、钙、黏着斑等信号通路。免疫浸润分析结果显示GLIS3表达与CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞相关(P<0.05)。结论 GLIS3在胃癌中表达上调，可作为胃癌的诊断和预后的标志物，且与免疫浸润有关。

• 单位
  甘肃省消化系肿瘤重点实验室; 兰州大学第二医院