2013-2015年江苏省腮腺炎病毒基因特征和G基因型病毒株全基因序列分析

作者：邓秀英; 胡莹; 陆培善; 郭宏雄

来源：中国疫苗和免疫, 2020, 26(05): 534-539.

DOI：10.19914/j.cjvi.2020.05.011

• 腮腺炎病毒
• F基因型
• G基因型
• 全基因组
• 基因特征

目的分析江苏省腮腺炎病毒(Mumps virus,MuV)流行株SH基因特征和G基因型MuV全基因序列特征。方法对江苏省2013-2015年流行性腮腺炎病例的咽拭子标本进行MuV分离和基因分型,分析F和G基因型MuV的SH基因特征;对G基因型MuV进行全基因序列测定和拼接,重点分析F、HN和N蛋白基因特征。结果共获得2013-2015年178株F基因型和6株G基因型MuV流行株。SH基因亲缘关系树显示,F、G基因型流行株与其参考株之间核苷酸遗传距离分别为0.048-0.010、0.032-0.054,且G基因型形成两个独立分支。全基因序列分析显示,G基因型MuV的HN蛋白出现N-糖基化位点增加或减少,发生HN蛋白E356D、Y442S、I279T和I287V变异、N蛋白L457A、T466N、M492I和N495H变异以及F蛋白K101R变异。结论江苏省2013-2015年MuV流行株以F基因型为主;并发现G基因型MuV且发生一定变异。

• 单位
  江苏省疾病预防控制中心