2011年,南京军区南京总医院积极响应总部开展研究型医院建设的目标要求,聚焦使命任务和能力建设,围绕"国内一流、国际知名的转化型医院"发展目标,结合连续7年主题年建设活动经验,把年度发展主题确定为"研究型医院建设",用创新驱动切实加强医院内涵质量建设,在卫勤保障能力、为部队服务水平、学科人才建设、医疗数质量指标、教学质量层次、科技创新成果均取得不同程度的进步。