家蚕Wnt信号通路下游关键基因Pangolin转录剪接体X3的克隆和分析

作者：王叶菁; 付秋杰; 殷子晴; 何华伟^*

来源：昆虫学报, 2022, 65(12): 1592-1597.

DOI：10.16380/j.kcxb.2022.12.004

• 家蚕
• Wnt
• Pangolin X3
• 基因克隆
• 序列分析
• 表达特征

【目的】克隆家蚕Bombyx mori Wnt信号通路下游关键基因Pangolin isoforms A/H/I/S转录剪接体X3 (Pangolin X3),分析其序列和表达特征。【方法】从NCBI数据库检索家蚕Pangolin X3,根据其编码序列(coding sequence, CDS)设计引物，利用PCR从家蚕幼虫中肠和血淋巴中进行克隆并测序验证。利用SilkDB 3.0, SMART,多序列比对和系统发育树分析Pangolin X3的序列特征。利用qRT-PCR分析Pangolin X3在家蚕5龄第3天幼虫不同组织(头、血淋巴、体壁、性腺、中肠、前部丝腺、中部丝腺、后部丝腺、脂肪体和马氏管)中的相对表达水平。【结果】从家蚕幼虫中肠和血淋巴克隆了Pangolin X3(GenBank登录号：XM＿038020921)的CDS,其开放阅读框长1 560 bp,编码519个氨基酸残基，预测分子量为55.86 kD,预测等电点为7.53。Pangolin X3蛋白含有保守的β-catenin结合位点和HMG结构域，其氨基酸序列在不同的昆虫中比较保守，特别是与DNA结合的HMG结构域，而与β-catenin结合的N末端CTNNB1结构域部分氨基酸残基发生变异。组织表达谱显示，Pangolin X3在家蚕5龄第3天幼虫中肠、血淋巴和性腺中的相对表达水平较高，在头、体壁、前部丝腺、中部丝腺、后部丝腺、脂肪体和马氏管中的相对表达水平较低。【结论】本研究克隆了家蚕Pangolin X3,分析了其序列和表达特征，为深入研究家蚕Pangolin的生物学功能提供了基础。

• 单位
  家蚕基因组生物学国家重点实验室; 西南大学