基于单分子实时测序的金花茶全长转录组分析

作者：刘合霞; 姚金双; 刘雨; 谢心怡; 耿晓姗; 李博; 周兴文

来源：分子植物育种, 2021, 1-20.

• 金花茶
• 单分子实时测序
• 可变剪切
• 长非编码RNA

金花茶是中国特有植物，是培养黄色山茶花的珍贵种质资源，具有重要的观赏价值和药用价值，金花茶全长转录组测序数据有助于筛选出调控花色合成的基因，但是金花茶的全长转录组数据仍然缺乏，因此，在本研究中利用基于单分子实时测序技术对金花茶花芽、花蕾以及盛开的花进行混合样品的全长转录组测序。全长转录组测序结果表明，在28.2 G的原始测序数据中，共生成了179 645个全长非嵌合序列（FLNC），从中获得了45 372个高质量的全长转录本（Isoform）。对获得的全长转录本进行可变剪切分析及长链非编码RNA预测，鉴定出了7 752个可变剪接事件和1 730个长链非编码RNA序列；在基因注释分析中，Nr、SwissProt、KOG和KEGG数据库分别注释了43 348、36 909、29 452和42 163条转录本，检测到了1 787个转录因子。GO注释及KEGG代谢通路分析表明，金花茶的花芽、花蕾、开放花朵等组织的基因表达谱主要与次生代谢物质合成、细胞功能以及细胞组分合成有关。本研究提供了大量的全长转录本序列，为今后金花茶的分子生物学和遗传学研究奠定了基础。

• 单位
  玉林师范学院; 福建工程学院