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摘要
针对分子动力学串行计算速度不足问题，设计一种基于MPI+OpenMP的并行编程模型，实现LAMMPS并行计算。从而满足在节点间采用MPI进行消息传递并行，在节点内采用OpenMP共享内存模式多线程并行；最后根据分子动力学自身计算特点，对近邻表的构建以及力的计算进行优化，同时将并行结果和串行结果以及纯OpenMP运行时间和混合模型运行时间作对比。实验结果表明，采用MPI+OpenMP混合并行编程模型不仅能够加快计算速度，而且具有很好的扩展性。
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单位周口师范学院
