肉牛大理石花纹等级相关lncRNA筛选与特征分析

作者：曾灵; 张岩峰; 李承隆; 丁燕玲; 周小南; 明文轩; 苏总华; 曲畅; 徐俊杰; 史远刚; 康晓龙^*

来源：华北农学报, 2023, S1: 371-380.

• 肉牛
• 大理石花纹
• 长链非编码RNA
• 肌内脂肪
• 肉品质

牛肉大理石花纹特征是由多基因调控的重要肉质性状，是衡量高档牛肉品质的条件之一。LncRNA是一种重要的非编码RNA,在调节脂肪沉积的相关生物学过程中发挥重要作用。为了解lncRNA在肉牛不同大理石花纹表型中的潜在生物学作用，采集高(A5)、低(A1)2种极端等级大理石花纹的杂交和牛背最长肌组织，利用高通量测序方法检测与肉质大理石花纹相关的差异lncRNA,预测差异lncRNA反式作用靶基因，并对其进行功能富集分析。结果表明，在2个等级大理石花纹牛肉组织中共筛选出45个显著差异lncRNA,其中在高等级大理石花纹组织中分别有21,24个显著上调及下调的lncRNA,包括MSTRG.9509.3、ENSBTAT00000077612、ENSBTAT00000072841等与脂肪沉积相关的lncRNA。对反式作用靶基因的功能富集分析表明，预测靶基因显著富集到脂多糖结合、脂肪分解等脂肪沉积相关的生物学过程。差异lncRNA可能通过反式作用靶向脂肪沉积相关基因(FABP4、PLIN1、LIPE等)参与调节肉牛大理石花纹表型特征。检测到的牛肉大理石花纹相关差异lncRNA、预测靶基因及其富集通路将为拓展对非编码RNA生物学功能的认识及其与牛肉大理石花纹特征的关系奠定基础，也为农业家畜的优质性状解析与新品种培育提供参考。

• 单位
  宁夏大学; 动物科技学院