生殖道沙眼衣原体感染临床症状隐匿,可导致严重并发症。体外细胞模型研究表明,沙眼衣原体暴露于不利条件下时,宿主细胞内的沙眼衣原体停止增殖,物质代谢低下,进入逃逸宿主免疫防御的一种可逆的持续感染状态。体内与体外沙眼衣原体感染的"持久性"不完全等同,沙眼衣原体与感染宿主之间存在长期相互作用,相互斗争的关系。但对沙眼衣原体在人体形成的长期感染状态,目前尚无公认定论。