藿香叶绿绒蒿叶绿体全基因组特征分析

作者：金玲; 张颖敏; 张雪梅; 李国栋

来源：分子植物育种, 2022, 1-16.

• 藿香叶绿绒蒿
• 叶绿体基因组
• 基因组结构
• 系统发育分析

藿香叶绿绒蒿(Meconopsis betonicifolia Franch.)是罂粟科绿绒蒿属观赏价值极高的高山野生花卉。本研究采用Illumina Hiseq 4000测序平台以及相关数据分析软件对藿香叶绿绒蒿的叶绿体全基因组进行测序、组装、注释和特征分析。结果表明，藿香叶绿绒蒿叶绿体基因组大小为151 935 bp，小单拷贝区(SSC)、大单拷贝区(LSC)分别为17 746、83 147 bp，反向重复区(IR)大小为25 521 bp。总GC含量为38.8%。叶绿体基因组共编码129个基因，包括37个tRNA基因，84个蛋白编码基因以及8个rRNA基因。对密码子进行统计可知，该物种的67种密码子编码了21种氨基酸。序列鉴定出34个SSR位点。基于核苷酸多样性分析共筛选到4个高突变片段(psbM-trnY-GUA， trnD-GUC-trnE-UUC， ndhF-rpl32， ndhH-ycf1)。利用最大似然(maximum likelihood， ML)法构建系统发育树，结果表明，藿香叶绿绒蒿Mbetonicifolia与同属植物全缘叶绿绒蒿Meconopsis integrifolia亲缘关系较近。藿香叶绿绒蒿叶绿体全基因组解析和系统发育分析，为研究该属植物的分子鉴定、遗传多样性和系统发育提供了基因资源。

• 单位
  云南中医药大学; 第一临床医学院