摘要
目的:基于网络药理学预测苔黑酚葡萄糖苷(OG)治疗骨质疏松的作用靶点及相关信号通路,应用分子对接和体外实验验证,从而揭示其潜在作用机制。方法:通过Similarity ensemble approach(SEA),SwissTargetPrediction数据库获取OG药物靶点;通过疾病相关的基因与突变位点数据库(DisGeNET),GeneCards数据库获取疾病靶点,交叉分析筛选出OG与骨质疏松共同作用靶点。利用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,随后利用Cytoscape 3.7.2软件中的CytoNCA插件进行拓扑分析筛选出核心靶点。其次,通过g:Profiler基因注释网站对所得共同靶点进行基因本体(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后,AutoDock Vina软件用来进行分子对接以及体外细胞实验验证OG的抗骨质疏松作用。结果:OG与骨质疏松的相关靶点73个,其中关键靶点14个。GO和KEGG功能富集分析结果表明,OG治疗骨质疏松涉及259个细胞生物学过程,主要包括有机氮化合物的代谢、细胞群增殖、蛋白质代谢过程、应激反应的调节、化学反应等。其作用机制可能与糖基化终末产物/糖基化终末产物受体(AGE/RAGE),白细胞介素-17(IL-17),磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)等信号通路相关。分子对接提示OG与关键靶点细胞周期蛋白D1(CCND1或Cyclin D1),周期蛋白依赖性激酶4(CDK4)的结合能最低且相近。流式细胞仪检测结果显示,与正常组比较,OG组G0/G1期细胞比例下降(P1,CDK4蛋白的表达(P1,CDK4的表达改变细胞周期,从而促进细胞增殖。
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单位重庆市中医院; 成都中医药大学