潞党参道地性形成相关转录因子筛选及表达分析

作者：翟宇佳; 戴俊利; 刘幸; 田星锐; 吉姣姣^*; 高建平^*

来源：中国中药杂志, 2023, 48(21): 5779-5789.

DOI：10.19540/j.cnki.cjcmm.20230727.101

• 潞党参
• 转录组
• 差异转录因子
• 表达分析

为了挖掘影响山西道地药材潞党参道地性形成的转录因子，该研究基于山西潞党参与甘肃白条党转录组数据筛选潞党参特异性转录因子，并对其进行基因表达模式分析，为通过分子辅助育种进行潞党参优种选育提供理论基础。根据不同产地潞党参与白条党转录组数据，对差异转录因子进行GO功能注释、鉴定、保守基序分析及基因表达模式分析。自转录组数据库中共筛选出61个差异基因，分属最多的AP2/ERF-ERF家族的保守基序为[2X]-[LG]-[3X]-T-[3X]-[AARAYDRAA]-[3X]-[RG]-[2X]-A-[2X]-[NFP]。分析发现，差异基因中43个在潞党参中表达量显著高于白条党，包括AP2/ERF-ERF家族11个、NAC家族5个、bHLH家族1个、RWP-RK家族2个，而有18个转录因子基因在白条党中上调表达。转录结合活性、代谢进程、应激反应相关的GO terms分别为103、26、23个。不同器官特异性表达分析表明转录因子基因CpNAC92、CpNAC100、CpbHLH128、CpRAP2-7不仅在潞党参中上调表达，在根系中表达量也显著高于其他器官。环境胁迫条件下基因表达模式分析发现，除CpNAC100基因只响应低温、过铁胁迫外，其他3个基因均可响应低温、温差、过铁胁迫。潞党参特异性转录因子基因CpNAC92、CpNAC100、CpbHLH128、CpRAP2-7的筛选与表达分析，为进一步研究潞党参道地性形成机制奠定了理论基础。

• 单位
  山西医科大学