雨生红球藻己糖激酶基因的克隆和生物信息学分析

作者：石颖; 宋亚楠; 张宏江; 季春丽; 张春辉; 李润植^*; 崔红利^*

来源：激光生物学报, 2020, 29(04): 359-367.

• 己糖激酶
• cDNA全长
• 结构域
• 系统进化
• 雨生红球藻

本研究以雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)为研究对象,利用同源克隆和cDNA末端快速扩增技术(RACE)相结合的方法获得了雨生红球藻己糖激酶(HaeHK)基因的cDNA全长序列,并进行了序列分析。结果表明,HaeHK的cDNA全长为2 047 bp,其中开放阅读框的长度为1 716 bp,编码571个氨基酸。该蛋白预测的等电点(pI)为6.49,理论分子量为60.61 kD。经在线BLAST同源比对分析发现,其与团藻(Volvox carteri)和莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)来源HKs的相似性分别达到50%和46%。通过序列比对和结构域分析可知,HaeHK蛋白存在与高等植物来源HKs相似的结构域,且具有HK家族的显著特征。高级结构同源建模表明其具有典型的"蝴蝶"结构。系统进化分析显示,高等植物和真核绿藻(Chlorophyta)来源HKs可能来自共同的祖先。本文首次从雨生红球藻中获得编码HaeHK的基因序列,为雨生红球藻中HK的表达和功能研究奠定基础,同时为解析雨生红球藻己糖利用及代谢的分子机制提供线索。

• 单位
  山西农业大学