宏基因组二代测序在社区获得性肺炎中的应用价值

作者：张娟娟; 闫晓培; 李宁^*

来源：医学研究杂志, 2022, 51(12): 96-99.

• 宏基因组二代测序技术
• 肺泡灌洗液
• 社区获得性肺炎
• 病原体

目的 探讨宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)检测支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid, BALF)中病原微生物在社区获得性肺炎中的诊断价值。方法 选取2018年11月～2021年7月至苏州市立医院住院的初始治疗失败的社区获得性肺炎患者57例，所得BALF同时进行传统方法和mNGS检测，比较两种方法的诊断价值。结果 在57例患者BALF病原学检测中，mNGS的检出率高于传统方法(80.70%vs 33.33%),差异有统计学意义(P<0.05)。mNGS检测的采信率为84.78%,敏感度为90.70%,特异性为50.00%,阳性预测值为84.78%,阴性预测值为63.64%。mNGS检测细菌阳性率高于传统方法(43.86%vs 15.79%),差异有统计学意义(P<0.05),但两者检测真菌、结核及病毒的阳性率比较，差异无统计学意义(P>0.05)。mNGS联合传统方法检测后，75.44%(43/57)患者确诊，43.86%(25/57)患者根据mNGS检测结果调整了治疗方案。结论 在初治失败的社区获得性肺炎BALF病原学检测中，mNGS的检出率高于传统方法，尤其是对于细菌感染的诊断价值更高，可早期识别病原体，有效指导诊治。

• 单位
  南京医科大学; 苏州市立医院