MALDI-TOF MS与16S rDNA方法对弧菌科微生物的鉴定与系统分类学分析

作者：何江; 朱军; 胡双双; 聂国嫒; 杨庆贵; 孙立新^*

来源：中国微生态学杂志, 2019, 31(07): 836-840.

DOI：10.13381/j.cnki.cjm.201907020

• 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
• 16S rDNA
• 弧菌科微生物
• 鉴定
• 系统分类学分析

目的比较基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)与16S rDNA方法对弧菌科微生物的鉴定及系统分类学分析能力。方法对19株弧菌科微生物,采用MALDI-TOF MS进行蛋白质图谱采集,通过对特征峰的分析,实现对微生物的鉴定和系统分类学分析;同时对19株微生物进行16S rDNA测序,用邻接法对16S rDNA序列进行鉴定和系统分类学分析,比较两种方法在弧菌科微生物鉴定和系统分类学分析中的异同。结果两种方法对19株弧菌科微生物的种属鉴定结果一致。系统分类学分析中,多株同种属的弧菌的两种方法分析结果一致,但对拟态弧菌和霍乱弧菌在树状图中的位置和亲缘关系,两种方法差异较大。结论 MALDI-TOF MS与16S rDNA均能够快速准确地鉴定弧菌科微生物,但利用MALDI-TOF MS进行系统分类学分析还有待数据库的扩大及算法的优化。

• 单位
  江苏国际旅行卫生保健中心