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摘要
【目的】开发能够准确、便捷、快速鉴定普通油茶与小果油茶的叶绿体基因分子标记，为油茶遗传资源的挖掘与利用提供参考。【方法】基于高通量测序技术组装了普通油茶和小果油茶的叶绿体全基因组，通过比较基因组学技术寻找两者叶绿体全基因组的差异，并根据其差异来开发可用于鉴定普通油茶与小果油茶的分子标记。为验证标记的有效性，分别选取具有代表性的12个普通油茶居群和6个小果油茶居群的个体，提取叶绿体全基因组，进行PCR扩增和凝胶电泳检验。【结果】组装的普通油茶与小果油茶叶绿体基因组序列全长分别为156 977、156 539 bp，两者叶绿体全基因组具有高度的保守性，但小果油茶在atpH基因与atpI基因间的非编码区存在长度为452 bp的大片段缺失。所开发引物的PCR扩增结果表明，所有普通油茶样本均可扩增出609 bp的条带，而小果油茶扩增出227 bp的条带，条带差异显著且稳定。【结论】使用所开发的分子标记能够稳定、便捷、精确地鉴定出普通油茶与小果油茶，但是使用时应先确定所鉴定的物种为普通油茶和小果油茶中的一种。
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