广西沿海红树林土壤放线菌多样性、新颖性及抗菌活性研究

作者：何子邦; 李顺莲; 吴友浪; 陈明胜; 庹利^*

来源：中国抗生素杂志, 2022, 47(05): 463-473.

DOI：10.13461/j.cnki.cja.007330

• 红树林
• 放线菌
• 多样性
• 新颖性
• 抗菌活性

目的 研究广西3个主要红树林生态区土壤放线菌资源的多样性和新颖性，为研发微生物药物提供菌种资源储备。方法 从广西茅尾海、北仑河口、山口红树林自然保护区采集27份土壤样品；采用稀释涂布法和8种分离培养基进行放线菌的分离纯化；菌株纯化后，采用Chelex-100法提取基因组DNA；通过PCR扩增和测序，获得菌株16S rRNA基因序列，并提交到EzBioCloud数据库中进行相似性搜索比对；构建基于16S rRNA基因序列的系统进化树，进行多样性和新颖性分析；潜在放线菌新种经发酵离心后，上清液用乙酸乙酯萃取、浓缩，采用纸片扩散法进行抗菌活性检测。结果 分离出菌株246株，其中放线菌181株，分布于6个目12个科19个属，菌株M2SK6-2、M2SK3-10、M5SK3-12和M1QZ16-11分别与最近有效种Streptomyces avicenniae DSM 41943T、Rhodococcus olei JCM 32205T、Agromyces kandeliae Q22T和Humibacillus xanthopallidus KV-663T的16S rRNA基因序列相似性最高，相似率分别为97.4%、97.7%、98.4%和98.4%，为潜在新种；4株潜在放线菌新种中，菌株M2SK6-2对多种革兰阳性菌具有较强的抗菌活性。结论 广西沿海红树林放线菌资源丰富多样，新颖性高，具有从中发现放线菌新物种和新次级代谢产物的潜力，值得深入研究。

• 单位
  遵义医科大学; 基础医学院