龙眼SAP-PPD-KIX-TPL信号途径基因家族的全基因组鉴定与表达模式

作者：韩婕; 陈晓慧; 申序; 李晓斐; 林玉玲; 吴鹏飞; 赖钟雄^*

来源：应用与环境生物学报, 2022, 28(02): 440-450.

DOI：10.19675/j.cnki.1006-687x.2020.07024

• 龙眼
• SAP-PPD-KIX-TPL信号途径
• 成员鉴定
• 生物信息学分析
• 实时荧光定量PCR

STERILE APETALA(SAP)可调控PPD-KIX-TPL转录抑制复合体的稳定性，从而调节器官大小.基于龙眼基因组数据库，对龙眼SAP-PPD-KIX-TPL信号途径的基因家族进行全基因组鉴定，分析龙眼SAP、PEAPOD(PPD)和TOPLESS(TPL)家族成员的基本理化性质、基因结构及蛋白结构域、启动子顺式作用元件、蛋白互作网络、构建系统进化树；分析龙眼体胚发生过程及不同组织部位中的基因表达水平，并采用qRT-PCR检测体胚发生早期及不同激素处理下的表达模式.结果表明，DlSAP包含1个成员，具有WD40结构域，只有1个内含子.DlPPD包含7个成员，具有tify和CCT＿2结构域，含有2-7个内含子，最保守基序为motif1.DlTPL包含6个成员，具有LisH、CTLH和WD40结构域，含有23-29个内含子，除motif7外，motif1-10中的剩余基序均保守.龙眼kinase-inducible domain interacting(KIX)家族包含8个成员，保守结构域为KIX.顺式作用元件预测表明，DlSAP、DlPPD和DlTPL启动子均包含大量光响应、激素应答和非生物胁迫响应元件.蛋白互作网络预测显示，SAP和PPD之间的互作关系较强，与TPL相关联的蛋白较多. qRT-PCR结果表明，DlSAP、DlTIFY4B和DlTPR2-1在球形胚阶段表达量最高；DlSAP、DlTIFY10B-1和DlTPR2-1在不同激素处理中均出现多种表达模式.总之，龙眼SAP-PPD-KIX-TPL信号途径的基因可能参与响应多种激素和非生物胁迫应答，也可能参与胚胎发育，具有多种生物学功能.（图9表2参33）

• 单位
  福建农林大学