基于数据挖掘、网络药理学和分子对接探究中医药治疗房颤的核心中药及机制

作者：邓良英; 孙园园; 高磊; 王炜; 石开虎^*

来源：特产研究, 2023, 45(03): 103-113.

DOI：10.16720/j.cnki.tcyj.2023.085

• 房颤
• 中药
• 数据挖掘
• 网络药理学
• 分子对接
• 用药规律
• 丹参
• 苦参

本研究主要挖掘数据,分析中药治疗房颤的用药规律,并通过网络药理学、分子对接及分子动力学方法探究其核心药对机制。检索知网、维普等数据库的中医药治疗房颤的临床资料,运用SPSS Modeler 18.0进行关联规则分析房颤用药规律;通过TCMSP数据库、OMIM和DrugBank等数据库分析核心药对的活性成分及潜在靶点,构建房颤靶点-活性成分-药物网络;通过String数据库得到房颤核心靶点PPI网络,以及使用Metascape进行GO生物功能分析和KEGG通路分析;对关键成分与关键靶点进行分子对接验证,最后进行分子动力学模拟。结果显示:治疗房颤用药频率前五分别是丹参、炙甘草、麦冬、桂枝和当归,高频药对有“丹参-苦参”、“麦冬-五味子”等。对“丹参-苦参”核心药分析发现其通过槲皮素、木犀草素和丹参酮ⅡA等关键成分作用于房颤AKT1、TNF、IL-6、VEGFA、IL-1β和CASP3核心靶点,参与NF-κB信号通路、cGMP-PKG信号通路和AMPK等通路。分子对接显示,槲皮素、木犀草素、丹参酮ⅡA与AKT1、CASP3、IL-1β等靶点紧密结合,AKT1-丹参酮ⅡA为结合亲和力最高的复合物,分子动力学模拟发现,蛋白-配体构象在40 ns形成稳定构象,并在活性位点形成了氢键。治疗房颤中药主要有丹参、麦冬和桂枝等,关键成分丹参酮ⅡA可能通过调控AKT1等关键靶点治疗房颤,参与NF-κB信号通路、cGMP-PKG信号通路和AMPK等通路,并在调控离子通道和影响炎症因子释放等方面发挥治疗房颤的作用。

• 单位
  南京中医药大学; 江苏省中医药研究院