基于分子对接技术分析白术治疗2型糖尿病的核心靶点

作者:袁龙飞; 李亚辉*; 杨欣; 张文洁; 刘彤玲; 杨敏; 杨美红
来源:中医药信息, 2022, 39(05): 34-38.
DOI:10.19656/j.cnki.1002-2406.20220506

摘要

目的:基于分子对接技术初步探索白术治疗2型糖尿病的核心靶点。方法:基于GEO数据库筛选2型糖尿病靶点,对靶点进行核心靶点及GO分析,通过TCMSP数据库下载白术化学成分。基于SYBYL对小分子配体进行优化,通过Surflex-Dock模块完成小分子配体及蛋白的分子对接。结果:获得2型糖尿病差异基因638个。对GSE25724样本的差异表达基因进行层次聚类分析输出前40个差异基因,核心靶点分析发现前蛋白转化酶枯草溶菌素1(neuroendocrine convertase 1,PCSK1),胰岛淀粉样多肽(islet amyloid polypeptide,IAPP),骨硬化病相关跨膜蛋白1(osteopetrosis-associated transmembrane protein 1,OSTM1)为关键靶点。分子对接技术发现白术21个化学成分与PCSK1有较好的结合(total score> 5)。33个化学成分与IAPP有较好的结合(total score> 5)。21个化学成分与OSTM1有较好的结合(total score> 5)。通过交集分析发现,白术12个化学成分同时与PCSK1、IAPP和OSTM1有较好的结合。结论:筛选出的差异基因及化学成分为实验研究提供依据。