龙眼ERF家族成员鉴定及其在体胚发生早期的表达

作者：陈燕; 吕科良; 厉雪; 高玉莹; 林玉玲; 赖钟雄^*

来源：西北植物学报, 2018, 38(11): 1986-1999.

• 龙眼
• 体胚发生早期
• ERF
• qRT-PCR

为了解龙眼ERF家族的基本性质以及在体胚发生早期的表达规律,该研究对龙眼基因组鉴定出108个ERF家族成员进行基本理化性质分析与进化树构建,并结合龙眼转录组及miRNA、lncRNA数据库对DlERF家族成员与lncRNA、miRNA之间的关系预测与表达模式分析。结果显示:(1)理化性质及进化树分析表明,AP2/ERF结构域在龙眼中相对最为保守,DlERF对龙眼的抗胁迫能力以及对病菌的防御能力可能起着重要作用。(2)RNA-Seq中的表达量分析可知,95个ERF基因在转录组中检测到表达,在愈伤组织(EC)、不完全胚性紧实结构(ICpEC)与球形胚(GE)阶段中分别存在31、11与53个ERF基因高表达。(3)qRT-PCR结果显示,在龙眼体胚发生早期显著表达5个ERF基因中,Dlo008317.1ERF15-2、Dlo022310.1ERF1-1与Dlo009939.1ERF98在GE阶段表达量显著高于EC与ICpEC阶段,Dlo009070.1ERF106-3与Dlo022634.1ERF22-1则分别在EC与ICpEC阶段高表达。(4)DlERF家族成员与相关lncRNA、miRNA表达量分析显示,LTCONS00013739对靶基因Dlo008317.1ERF15-2为正调控关系;DlomiR413与DlomiR1510a共同靶向Dlo009070.1ERF106-3,从EC到GE阶段均表现出显著负调控关系,而DlomiR413与Dlo008317.1ERF15-2的表达量表现出正相关,推测相比于Dlo008317.1ERF15-2,DlomiR413更倾向于调控Dlo009070.1ERF106-3;调控Dlo009939.1ERF98相关的DlomiR408与DlomiR774b,从表达趋势来看,DlomiR774b在龙眼体胚发生早期过程能够负调控Dlo009939.1ERF98;DlomiR399c与Dlo022310.1ERF1-1在EC到GE阶段可能存在负调控关系。(5)不同梯度浓度的乙烯处理使得DlERF基因表达显著下调。这些发现提供了有关龙眼体胚发生早期DlERF的重要见解,从而为将来对龙眼体胚发生早期过程中DlERF的功能分析奠定了基础。

• 单位
  福建农林大学