本发明的一种多模光纤单像素成像降噪方法及存储介质,用于提高多模光纤单像素成像质量。该方法首先利用多模光纤单像素成像系统获取原测量矩阵及原测量值;然后对原测量矩阵和原测量值依次进行差值处理,加权处理,归一化处理以及去均值处理,得到优化测量矩阵和优化测量值,对优化测量矩阵和优化测量值利用压缩感知重构算法恢复目标图像。相比于原始方案中直接对原测量矩阵和原测量值进行去均值处理后压缩重构恢复的图像,使用本发明方法恢复图像具有更好的重建质量。