人参属植物达玛烷合成酶基因的生物信息学分析

作者：张莹; 王广; 左天; 张小海; 徐燃; 张祚; 张绍鹏^*

来源：武汉轻工大学学报, 2019, 38(02): 25-30.

• 人参属
• 达玛烷合成酶
• 理化性质
• 生物信息学分析

对人参属植物皂苷生物合成途径中已知的达玛烷合成酶基因及其蛋白序列进行分子层面的比较分析,揭示该基因在不同物种间的进化关系。从Genbank中找到目前已公布的12种人参属植物达玛烷合成酶基因的序列信息,利用生物信息学方法对这些序列进行开放阅框预测、核酸及氨基酸序列的比对、序列理化性质分析、蛋白结构域预测以及系统发育树的构建。结果表明不同物种间的达玛烷合成酶基因在核苷酸和氨基酸平均相似性分别为99. 13%和98. 85%。通过系统发育树分析发现这12种不同来源的达玛烷合成酶基因按照聚类关系主要分为两个大分支,其中大部分之间有着较高的亲缘关系。通过生物信息学方法对人参属植物达玛烷合成酶基因进行分析,为深入阐明人参属植物中达玛烷皂苷途径的在不同物种间的进化关系,为探索人参皂苷合成的分子机制提供理论上的依据。

• 单位
  武汉轻工大学