贵州威宁红花油茶的叶绿体基因组特征分析

作者：李倩; 郭其强; 高超; 李慧娥^*

来源：园艺学报, 2020, 47(04): 779-787.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0410

• 威宁红花油茶
• 叶绿体基因组
• 系统发育

对威宁红花油茶(Camelliaweiningensis)的叶片高通量测序数据进行叶绿体全基因组的组装和注释分析。其叶绿体全基因组长为156 490 bp,包含典型的四分体结构,序列已登录Gen Bank(MK820035)。叶绿体全基因组比较分析表明,与其他山茶属物种一样,其结构与基因排序均保守,但在基因组的反向重复区边界处表现出明显区别。简单重复序列(SSR)分析表明,全基因组仅包含51个单核苷酸重复的SSR,且仅为A/T重复类型。系统发育分析表明,威宁红花油茶与腾冲红花油茶亲缘关系最近,但其所处分支包含的4个山茶属物种的分组与传统分类不一致。

• 单位
  贵州大学