科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
目的:应用食管鳞癌淋巴结转移的关键mRNA分子构建最佳淋巴结转移预测模型。方法:获取GSE53624和GSE53622中食管鳞癌转录组数据,XGBoost算法gain值确定食管鳞癌淋巴结转移关键mRNA分子,构建基于XGBoost, LR及SVM的淋巴结转移预测模型并评价其效能(AUC和K-S法),生存分析和GO富集分析关键mRNA分子的预后意义及生物学功能。结果:159个食管鳞癌差异表达mRNA分子中关键mRNA分子有18个;3种淋巴结转移预测模型中,XGB-18 mRNA模型的AUC和K-S值最优,并且其预测值是食管鳞癌预后的独立危险因素;18个mRNA分子中的4个低表达分子富集于上皮细胞角质化过程,在淋巴结转移阳性食管鳞癌中表达进一步降低。结论:XGB-18 mRNA模型诊断食管鳞癌淋巴结转移的效能最优,并且是食管鳞癌独立预后危险因素之一。
- 单位
