实现经济高质量发展离不开国家创新水平的提升,从公共产品理论和市场失灵理论出发,对高新技术企业财政补贴行为进行理论分析,我国高新技术企业财政补贴制度存在补贴对象和补贴标准不合理、补贴流程不够规范等问题,公平竞争审查制度的贯彻落实是从源头清理不恰当补贴制度的必然选择,除此之外,应当从完善高新技术企业财政补贴的顶层设计,评估机制的全流程覆盖等方面出发,完善我国高新技术企业财政补贴制度。