吉林省2011年手足口病死亡病例肠道病毒71型分离株全基因组基因特征分析

作者：魏雷雷; 周剑惠; 黄飚; 邓立权; 王爽; 李可维; 单元春; 杨尧; 曹凤瑞; 程涛; 付思美

来源：中国生物制品学杂志, 2017, 30(11): 1146-1149.

DOI：10.13200/j.cnki.cjb.001993

• 手足口病
• 肠道病毒71型
• 全基因组

目的分析吉林省2011年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)死亡病例标本中分离获得的肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)毒株全基因组基因特征。方法采用分段RT-PCR法对2011年吉林省HFMD死亡病例EV71分离株JL2011-56全基因组进行扩增和测序。利用Clustal X2和MEGA5软件构建分离株JL2011-56与Gen Bank中27株参考株的全基因组序列和VP1区全基因组序列的进化树,分析Jl2011-56株的流行病学特征;同时与Gen Bank中12株C4a基因亚型参考株进行全基因组核苷酸和氨基酸序列的同源性分析。结果 JL2011-56分离株属于C4a亚型,核苷酸序列和氨基酸序列与山东分离株SDLY107(JX244186.1)同源性最高,分别为99.2%和99.5%,与EV71原型株Br Cr的同源性分别为79.9%和95.7%。结论 JL2011-56分离株与山东株亲缘关系较近,可能存在共同的与中枢神经毒力相关的氨基酸突变位点。

• 单位
  吉林省疾病预防控制中心; 吉林省卫生监测检验中心