一例Say-Barber-Biesecker-Young-Simpson综合征患儿的 KAT6B基因变异分析

作者：吴若豪; 唐文婷; 邱坤银; 李宇; 何展文^*

来源：中华医学遗传学杂志, 2021, 38(06): 561-564.

• KAT6B基因
• Say-Barber-Biesecker-Young-Simpson综合征
• 新发变异
• 错义变异

目的对1例Say-Barber-Biesecker-Young-Simpson综合征患儿的KAT6B基因变异进行分析, 明确其可能的致病原因。方法提取患儿及双亲外周血DNA, 应用全外显子基因组测序法检测相关基因变异, 并通过Sanger测序法验证可疑变异, 对其进行生物信息学预测。结果全外显子基因组测序结果显示患儿KAT6B基因第13外显子存在c.2623C>T (p.Asp875Tyr)错义变异, 该变异既往未见报道, 且为新发(de novo)变异(PS2), 在主要人群基因频率数据库中均不存在(PM2)。经PolyPhen-2、MutationTaster、PROVEAN等软件预测, 均提示c.2623C>T (p.Asp875Tyr)变异为有害变异;同时经UCSF chimera及CASTp软件对编码蛋白3D结构进行建模及酶活性位点定位, 发现该氨基酸的改变可影响编码蛋白原有的酶结合口袋空间大小, 进而影响其与底物结合的能力, 导致原有酶功能丧失(PP3)。根据美国医学遗传学与基因组学学会指南判定为可能致病变异(PS2+PM2+PP3)。结论 KAT6B基因c.2623C>T(p.Asp875Tyr)变异可能为该患儿罹患Say-Barber-Biesecker-Young-Simpson综合征的原因。

• 单位
  中山大学肿瘤防治中心; 中山大学孙逸仙纪念医院