环状RNA在小鼠肺发育中的连续表达及功能预测

作者：付雪; 杨洋; 沈艳青; 周晓光; 周晓玉

来源：中国当代儿科杂志, 2020, 22(10): 1125-1130.

• 肺发育
• 环状RNA
• 生物信息学分析
• 小鼠

目的探讨环状RNA(circRNA)circ4:150439343|150477468和circ15:73330849|73343359在小鼠肺发育中的连续表达及潜在功能。方法根据肺发育分期,取孕16.5 d(E16.5 d)、孕18.5 d(E18.5 d)及生后2 d(P2 d)胎鼠及新生小鼠的肺组织,利用苏木精-伊红染色观察肺组织形态学;利用qRT-PCR技术检测晚期肺发育过程中circ4:150439343|150477468和circ15:73330849|73343359的表达情况;应用miRanda和TargetScan软件预测circRNA的靶向miRNA,然后对靶基因进行GO和KEGG分析并预测相应circRNA功能。结果在E16.5 d小鼠肺组织切片中观察到Ⅱ型肺泡上皮细胞,且逐渐增多,P2 d时肺泡迅速扩张,间质变薄,肺泡结构逐渐成熟;qRT-PCR结果显示circ4:150439343|150477468相对表达量随时间推移持续上调(P<0.05),circ15:73330849|73343359的相对表达量先下调再上调(P<0.05);宿主基因功能预测显示circRNA可参与Notch、PI3K-Akt和NF-κB等信号通路。结论 circ4:150439343|150477468和circ15:73330849|73343359可通过Notch等信号通路参与肺发育的调控。[中国当代儿科杂志,2020,22(10):1125-1130]

• 单位
  南京医科大学