广西野生金线莲根际微生物多样性分析

作者:朱惠; 朱宇林; 牛俊奇; 吴兰敏; 苏培丽; 陀富超; 吴有栋; 覃芳梅; 蔡婷婷; 苏建睦*
来源:分子植物育种, 2023, 1-18.

摘要

为筛选金线莲根际促生菌,本研究采集广西三个地区野生金线莲根际土壤,提取土壤中微生物DNA,对微生物核糖体16S RNA基因进行扩增子测序,分析和比较不同来源金线莲根际微生物的物种组成和功能组成。结果显示,广西三个地区野生金线莲根际微生物的香浓指数、辛普森指数均无显著差异。平南和容县两地之间的系统发育多样性指数、chao1指数、OTU数量差异显著,平南和凭祥之间无显著差异。凭祥和平南、容县两地之间的系统发育多样性指数、chao1指数、OTU数量均无显著差异。野生金线莲根际微生物中变形菌门的丰度最高(41.2%-58.0%),其次是酸杆菌门和放线菌门。野生金线莲根际微生物网络主要由三大模块组成,其中变形菌门中的农杆菌属(Agrobacterium)和拜纳蒙纳斯属(Balneimonas)是优势微生物属。此外,三个地区金线莲根际微生物的功能组成相近,微生物基因数量排前三的通路依次为光合作用通路、甘氨酸、丝氨酸与苏氨酸代谢通路和半胱氨酸与蛋氨酸代谢通路。综上,广西三个地区野生金线莲根际微生物的差异较小,变形菌门的丰度最高,其次是酸杆菌门和放线菌门。本研究为研究金线莲与微生物互作机制提供线索、为开发利用金线莲微生物菌肥提供理论基础。