香蕉多酚氧化酶基因编码序列的电子克隆和生物信息学分析

作者：谭琳; 陈娇; 李奕星; 李芬芳; 郑晓燕; 郑丽丽; 臧小平; 袁德保

来源：广东农业科学, 2013, 40(24): 112-116.

DOI：10.3969/j.issn.1004-874X.2013.24.029

• 香蕉
• 多酚氧化酶基因编码序列
• 电子克隆
• 生物信息学

用电子克隆方法获得香蕉多酚氧化酶(polyphenol oxidase,PPO)基因编码序列。采用生物信息学方法,对此序列编码的蛋白质从氨基酸组成、理化性质、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:香蕉PPO基因编码序列全长1 602 bp,包含1 602 bp开放阅读框(open reading frame,ORF),含有PPO功能域和酪氨酸酶功能域,在序列组成、高级结构及活性位点等方面,与小麦等其他植物的PPO基因具有高度的相似性。

• 单位
  中国热带农业科学院海口实验站