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摘要
车甲基杆菌(Methylobacterium currus TP-3)是一株分离自番茄(Lycopersicon esculentum)叶际的植物共生甲基营养细菌，有促生抗病的潜能。为挖掘其对植物有益的功能基因，本研究对车甲基杆菌TP-3进行了全基因组测序、组装和分析。结果表明：TP-3具有2条染色体和4个质粒，共7 740 048 bp，GC含量为70.38%。通过对基因组的分析，共预测到7 588个基因，在NR、COG、SwissProt、GO和KEGG数据库分别注释到6 816、5 588、4 494、3 957和3 118个基因。我们通过一些特定功能数据库或软件，预测了655个III型分泌系统效应蛋白相关基因，以及2 196个病原宿主互作相关基因。除此之外，还利用耐药基因数据库、碳水化合物相关酶数据库等，对TP-3的基因组功能有了较为全面的分析。通过深入讨论，对TP-3在叶际的适应性和促生潜力进行了遗传基础的分析。本研究为解析车甲基杆菌TP-3的基因组结构及功能提供了科学基础，阐述了其在甲基营养和促进植物生长方面的生活方式，及其成为叶际微生物制剂的可能性，并为未来进一步研究其功能基因及开展遗传编辑提供了基因组信息。
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