本发明公开了一种富含柠檬苦素的柑橘籽油及脱苦柑籽粕及其制备方法与应用。本发明利用从柑橘籽得到的初榨油重新浸提柑橘籽渣中的柠檬苦素,得到脱苦柑籽粕,同时精炼后获得的成品油富含柠檬苦素,具有营养保健功效,且带有特征的柠檬样香气。本发明直接利用初榨油作为浸提剂,工艺简单,不需添加外源性功效成分,不借助有机溶剂,绿色安全、高效、更适合工业化生产。制备得到的富含柠檬苦素的柑橘籽油在医药、保健食品和/或美容产品中具有应用前景,同时脱苦柑籽粕具有作为饲料原料或添加剂的应用潜力。