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摘要
为研究CD8+ T细胞的功能异常机制,对功能异常状态CD8+ T细胞和3种正常CD8+ T细胞亚型[中央记忆CD8+ T细胞(HCM)、效应记忆CD8+ T细胞(HEM)和na?ve CD8+ T细胞(HW)]的ATAC-seq(Assay for transposase accessible chromatin with high-throughput sequencing)数据进行基因调控网络比较,结果表明,3种正常CD8+ T细胞特异表达的基因参与维持相应T细胞正常功能的信号通路,功能异常CD8+ T细胞特异的基因参与癌症相关通路。转录因子调控网络比较分析发现功能异常CD8+ T细胞GMEB2转录因子表达关闭。细胞表面受体调控网络比较分析发现功能异常CD8+ T细胞CD7和P4HB受体的表达关闭。采用基因调控网络的数据进行比较分析,发现CD8+ T细胞功能异常机制可能与GMEB2转录因子、CD7和P4HB受体表达关闭有关,这为抗病育种寻找特定基因提供新思路。
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