基于生物信息学方法构建肝细胞癌铁死亡相关基因预后风险模型

作者：郝继; 柳科军; 牛一鸣; 唐超峰; 惠永峰; 陈本栋; 卜阳^*

来源：宁夏医学杂志, 2022, 44(08): 683-769.

DOI：10.13621/j.1001-5949.2022.08.0683

• 肝细胞癌
• 铁死亡
• 列线图
• 预后

目的 基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库，探索肝细胞癌中差异表达铁死亡相关基因与肿瘤预后的关系，构建肝细胞癌患者预后风险模型。方法 从TCGA数据库中下载肝细胞癌转录组和患者对应的临床数据，筛选出癌组织中的差异表达基因，同时结合FerrDb数据库，筛选出与肝细胞癌患者总生存期密切相关的铁死亡基因，采用Losso回归分析和Cox回归分析确认影响预后的关键基因并筛选出与预后相关的差异表达基因。COX回归分析用于构建评估预后的风险评分模型，用诺莫列线图及校准曲线评价模型的预测能力。结果 22个铁死亡相关基因在肝细胞癌组织与正常组织中表达差异有统计学意义(P<0.05);GO和KEGG分析显示，差异基因在肿瘤代谢等生物学过程显著富集(P<0.05);Lasso回归分析确认CARS1、FANCD2、SLC1A5、SLC7A11为影响预后的关键基因，成功构建基于铁死亡相关基因的预后模型，模型将所有患者分为高风险与低风险组且提示高风险组的总体生存率显著低于低分险组(P<0.05);ROC曲线显示，1年、3年和5年生存率的曲线下面积分别为0.765、0.673和0.687;多因素COX回归分析提示，风险评分是影响肝细胞癌预后的独立危险因素(HR=1.833,95%CI为1.257～2.673;P<0.05);诺莫列线图及校准曲线提示，预后模型具有良好的预测能力。结论 此研究成功构建了铁死亡相关基因的肝细胞癌预后模型，该模型可以对肝细胞癌患者的个体化治疗提供理论依据，并提高肝细胞癌患者的个体化预后预测结果的准确度。

• 单位
  宁夏回族自治区人民医院; 宁夏医科大学总医院; 宁夏医科大学