昆明地区儿童感染的GII型诺如病毒分子分型研究

作者：王莹; 曾洪艳; 代雷阳; 许彬; 沈茹; 贺晓丽; 邱丽娟^*

来源：病毒学报, 2021, 37(04): 886-893.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004388

• 诺如病毒
• 分子分型
• 急性胃肠炎

了解昆明地区诺如病毒在儿童中的流行特征和分型特点。统计整理昆明地区哨点医院,2018年6月-2019年10月内的1 588例通过荧光定量PCR鉴定为诺如病毒(Norovirus,NV)阳性的病例资料,包括检测时间、年龄及性别,分析流行病学特征。收集到其中荧光定量结果显示病毒相对含量较高的485份儿童腹泻标本,通过逆转录PCR方法成功获得107-ORF1和94-ORF2基因序列信息,进一步进行分子分型。昆明地区2018年11月开始,检出NV的病例逐步增加,至2019年1月,NV检出率开始降低。NV相关性腹泻的易感人群为3岁前幼儿,其中1岁以下患儿占40%,1岁～3岁患儿占56%,其余3岁～16岁患儿仅占4%。分子分型结果显示,流行株根据ORF1分为GIIP16、GIIP12、GII31三种亚型,依据ORF2的结果,属于GII.4、GII.2、GII.3个分支。Tajima中性检验预测RdRp(GII.P16),RdRp(GII.P31),VP1(GII.3),VP1(GII.3)的D值分别为-2.03,-1.51,0.14,-1.13,其中大部分D值小于0。其中VP1(GII.3)的D值为正值,有别于其他大部分预测结果,原因可能是样本量不足,需要在未来扩大样本量开展研究。NV对儿童的感染率在各年龄组间存在差异,在3岁以下儿童感染NV患病率较高。病毒呈季节性流行,主要集中在11月到次年2月。针对儿童患者,昆明地区同时流行3种不同基因型病毒株,优势流行株为GII.P31-GII.4。对突变频率较高的样本进行分析,其基因进化不遵循中性模型,需要进一步对病毒间基因重组进行分析。

• 单位
  昆明医科大学海源学院; 昆明市儿童医院