枯叶蛱蝶中华亚种基因组Survey分析

作者：洪芳; 徐堉峰; 范博

来源：泉州师范学院学报, 2022, 40(02): 11-16.

DOI：10.16125/j.cnki.1009-8224.2022.02.006

• 枯叶蝶
• 基因组Survey
• 杂合率
• GC含量

通过第二代高通量测序手段对枯叶蝶的基因组进行Survey分析，研究枯叶蛱蝶的起源、进化及适应性，明确适合该物种全基因组深度测序和组装策略.通过低覆盖度测序预测枯叶蝶基因组大小，并利用生物信息学方法估计该种的杂合率、重复序列和GC含量等基因组信息.结果显示：(1)枯叶蛱蝶中华亚种(Kallima inachus chinensis Swinhoe)的基因组大小估计为545.05 Mb, GC含量为35.24%,测序深度为52×;(2)除略小于Maniola jurtina (614.74 Mb)和翠袖锯眼蝶(Elymnia shypermnestra)(566.93 Mb)外，明显大于其余蛱蝶的基因组；(3)K-mer分析(K=17)结果显示枯叶蝶基因组具有明显的杂合峰，杂合率为1.22%,重复序列比例为48.03%.

• 单位
  泉州师范学院