斑点叉尾鮰Cbx基因家族的全基因组鉴定与进化分析

作者：张世勇; 陈校辉^*; 王明华; 钟立强; 秦钦; 邵俊杰; 刘洪岩; 王江; 边文冀^*; Jiang Hucheng

来源：基因组学与应用生物学, 2019, 38(04): 1488-1496.

DOI：10.13417/j.gab.038.001488

• 斑点叉尾鮰
• Cbx基因
• Chromo结构域
• 基因家族

利用Cbx家族基因高度保守的Chromo结构域氨基酸序列作为种子序列,检索斑点叉尾鮰(Ictalurus punetaus)基因组注释的蛋白数据库,共鉴定分离出14个Cbx基因。并在全基因组水平对斑点叉尾鮰Cbx基因家族进行了保守结构域序列、进化、基因结构、染色体定位的系统分析。本研究中鉴定出的斑点叉尾鮰Cbx家族基因蛋白序列与已知的人类、小鼠、鸡、斑马鱼等物种Cbx蛋白序列构建系统进化树。根据系统进化树分析结果,14个斑点叉尾鮰Cbx基因分成两个亚族,5个隶属于Hp1s亚族,9个隶属于PcGs亚族。Cbx基因主要分布于斑点叉尾鮰7条染色体中,且呈不均匀分布。本研究对于后续斑点叉尾鮰Cbx基因家族深入的功能验证及分子作用机制研究具有重要的意义,也为日益丰富的水产基因组资源的挖掘利用提供了参考。

• 单位
  江苏省淡水水产研究所