猪圆环病毒2型山西株全基因组序列分析

作者：孟帆; 吴忻; 姚敬明; 樊振华; 刘文俊; 王娟萍; 韩一超; 薛翼鹏; 米瑞娟; 李玉斌

来源：中国畜牧兽医, 2016, 43(12): 3127-3134.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2016.12.007

• 猪圆环病毒2型
• 全基因组
• 序列分析

为了解山西省猪圆环病毒2型(PCV2)的遗传变异情况,本试验采用PCR方法对山西省分离的4株猪圆环病毒流行株(SXXZ1株、SXXZ2株、SXTY株和SXJZ株)的全基因组进行了扩增、克隆和测序,并将其全基因组序列与国内外34株主要流行毒株进行核苷酸同源性与系统进化树分析。结果显示,4株PCV2山西流行株全基因组核酸序列全长SXJZ株为1 768bp,其余均为1 767bp,分别占25%和75%。4株毒株核苷酸同源性为95.9%100.0%,与国内外34株参考株同源性为94.5%99.9%,与国产疫苗株同源性为95.6%99.8%;PCV2全基因组序列进化分析表明,本研究分离的SXXZ1株、SXXZ2株和SXTY株属于PCV-2b基因型,SXJZ株属于PCV-2e基因型,其中SXXZ1株和SXXZ2株与广东QY株的进化关系最近,SXTY与奥地利AUT5株的进化关系最近,SXJZ与福建FJ株的进化关系最近;而SXXZ1株、SXXZ2株和SXTY株与山西PCV2疫苗DBN-SX07-2株的进化关系较近,SXJZ株与国内PCV2疫苗LG株的进化关系较近。从而证实在山西省流行的PCV2毒株以PCV-2b为主,同时还分离出了PCV-2e亚型,表明山西省存在PCV-2e亚型毒株。本试验结果为山西省PCV2的分子流行病学、遗传变异及防控奠定了基础。

• 单位
  山西省农业科学院畜牧兽医研究所